“技能系统”作为超兽武装ol的一个重要组成部分，在《超兽武装OL》中，共有17种属性技能，每个属性的超兽都拥有1个属于本属性的绝技，还可通过升级来学习其他技能。
注：
每个超兽只能拥有4个技能，拥有4个技能的超兽必须遗忘一个现有技能才能学习到新技能。
除了普通的技能外，系统还提供了“合体技”当只有一个超兽时，收集“异能量”达50%时，可发动单个合体技，当有2个或3个超兽时，收集“异能量”达100%时，可发生多个合体技。
当发动合体技时，战斗界面将显现首创分镜动画特写镜头的超酷战斗场面，华丽震撼。
